真邁生物與專注于單細(xì)胞技術(shù)服務(wù)的尋因生物開展深度合作，雙方整合技術(shù)資源優(yōu)勢，共同打造了高質(zhì)量的國產(chǎn)單細(xì)胞組學(xué)整體解決方案，該方案將為推動單細(xì)胞技術(shù)應(yīng)用和發(fā)展提供強有力的支持。
雙方合作開展了單細(xì)胞整體解決方案的性能評價工作，評價采用了尋因生物單細(xì)胞免疫組試劑盒構(gòu)建了多物種多組織樣本單細(xì)胞文庫，文庫樣本同時在SURFSeq 5000和NovaSeq 6000測序平臺進(jìn)行測試分析。
結(jié)果顯示，SURFSeq 5000在Clean bases ratio以及單細(xì)胞文庫質(zhì)控中的多項指標(biāo)均表現(xiàn)出色，其各樣本獲得read數(shù)、識別細(xì)胞數(shù)以及細(xì)胞中位基因數(shù)等指標(biāo)均優(yōu)于NovaSeq 6000。
?下機數(shù)據(jù)質(zhì)量高，Clean bases ratio表現(xiàn)更優(yōu)
?單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組文庫質(zhì)控結(jié)果優(yōu)異，且各樣本獲得read數(shù)、識別細(xì)胞數(shù)、每個細(xì)胞中位基因數(shù)等方面表現(xiàn)更優(yōu)
表2?單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組文庫質(zhì)控對比結(jié)果
圖2 共享cell barcode對比結(jié)果
圖3 高變基因相關(guān)性對比結(jié)果
注：每個點表示一個細(xì)胞表達(dá)基因分別在SURFSeq 5000 和 NovaSeq 6000平臺中的 UMI counts 分布。
?所有基因表達(dá)量相關(guān)性達(dá)90%以上
圖4 所有基因表達(dá)量相關(guān)性對比結(jié)果
圖7 各cluster中細(xì)胞比例結(jié)果
真邁生物與尋因生物聯(lián)手打造的國產(chǎn)單細(xì)胞組學(xué)整體解決方案展現(xiàn)出了優(yōu)異的性能與可靠性，該方案可為科研人員提供高質(zhì)量的單細(xì)胞組學(xué)數(shù)據(jù)，成為推動大規(guī)模單細(xì)胞測序深入研究的重要工具。